1. Αλλαγή τροφής: Συχνά βασιζόμενοι σε ξηρή χονδροειδή τροφή, η ξαφνική τροφή με πράσινη τροφή μπορεί να προκαλέσει φούσκωμα και διάρροια στα κουνέλια λόγω υπερκατανάλωσης τροφής, ενώ ορισμένα κουνέλια είναι πιο επιρρεπή σε διάρροια. Κατά την αλλαγή ροής, θα πρέπει να αυξάνεται ή να μειώνεται σταδιακά με σταδιακό τρόπο, κατά προτίμηση εντός 7-10 ημερών.
2. Δηλητηρίαση από ζωοτροφές: Το χόρτο περιέχει τοξικές ουσίες, όπως ορισμένα δηλητηριώδη ζιζάνια, φυτρωμένες πατάτες κ.λπ. Τρίτον, το γρασίδι παράγει ορισμένες τοξίνες κατά την επεξεργασία και την αποθήκευση.
3. Υπερβολική εξευγενισμένη τροφή: Τα κουνέλια είναι φυτοφάγα ζώα με μοναδικά πεπτικά φυσιολογικά χαρακτηριστικά. Εάν η αναλογία της επεξεργασμένης τροφής είναι πολύ υψηλή, ειδικά για αμυλούχα τρόφιμα όπως το καλαμπόκι, δεν θα αφομοιωθεί πλήρως και δεν θα απορροφηθεί στο λεπτό έντερο, γεγονός που αναπόφευκτα θα αυξήσει την επιβάρυνση στο οπίσθιο έντερο και θα προκαλέσει διάρροια λόγω πεπτικών διαταραχών.
4. Ξαφνικές αλλαγές στο περιβάλλον: οι ξαφνικές αλλαγές του καιρού, το κρυολόγημα σε χαμηλές θερμοκρασίες και διάφορες άλλες αντιδράσεις στρες (όπως σοκ, ξαφνικό κρύο και ζέστη, μεταφορά σε μεγάλες αποστάσεις κ.λπ.) μπορούν όλα να προκαλέσουν διάρροια στα κουνέλια.
5. Βακτηριακές ασθένειες: Η διάρροια των κουνελιών προκαλείται κυρίως από διάφορες βακτηριακές ασθένειες όπως το Escherichia coli, η νόσος Clostridium difficile, η νόσος Taynerella, η νόσος της σαλμονέλας, η ασθένεια κίτρινων ούρων σε νεαρά κουνέλια και η κοκκιδίωση των κουνελιών.
6. Πρόβλημα με το πόσιμο νερό: Εάν η πηγή νερού δεν είναι καθαρή ή επαρκής, τα κουνέλια μπορεί να εμφανίσουν αφυδάτωση και διάρροια.
